Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TMIGD1Q6UXZ0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms