Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KRT80Q6KB66 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms