Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TYW3Q6IPR3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms