Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC9A4Q6AI14 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC9A4Q6AI14 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms