Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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KRTAP21-3Q3LHN1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP21-3Q3LHN1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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