Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms