Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KLHL40Q2TBA0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms