Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL24A1Q17RW2 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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COL24A1Q17RW2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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COL24A1Q17RW2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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