Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP6Q16828 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms