Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms