Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms