Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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