Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COL4A6Q14031 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms