Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms