Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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NAE1Q13564 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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NAE1Q13564 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NAE1Q13564 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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