Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC1Q13547 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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