Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
BFSP2Q13515 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BFSP2Q13515 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms