Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CALCOCO2Q13137 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CALCOCO2Q13137 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CALCOCO2Q13137 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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