Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRAF2Q12933 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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