Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TROQ12816 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TROQ12816 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TROQ12816 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TROQ12816 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TROQ12816 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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