Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms