Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms