Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms