Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF2BQ00403 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms