Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms