Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARF3P61204 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms