Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms