Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMD4P55036 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms