Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP5P51878 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP5P51878 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP5P51878 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP5P51878 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms