Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GSK3BP49841 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms