Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms