Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMPOP42166 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMPOP42166 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms