Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms