Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GPC1P35052 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms