Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXA13P31271 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA13P31271 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms