Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNGA1P29973 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNGA1P29973 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms