Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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