Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTKP29376 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTKP29376 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTKP29376 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTKP29376 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTKP29376 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms