Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GCAP28676 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GCAP28676 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GCAP28676 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GCAP28676 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms