Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP1P28562 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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DUSP1P28562 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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