Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRGP23470 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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