Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPS6KB1P23443 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPS6KB1P23443 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms