Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NME1P15531 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NME1P15531 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NME1P15531 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms