Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms