Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LAMP1P11279 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms