Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GLI2P10070 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms