Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
C8orf88P0DMB2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C8orf88P0DMB2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms