Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXC4P09017 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms