Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLBP06746 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLBP06746 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POLBP06746 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POLBP06746 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms