Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX4O95219 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNX4O95219 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms